Modele de case mici

L`analyse de réseau représente une alternative prometteuse dans de telles circonstances limitées de données [22 – 24]. Comme beaucoup de voies moléculaires dans l`EIA sont qualitativement bien décrites, les réseaux d`interaction peuvent être une approche appropriée pour caractériser l`EIA. Ces réseaux sont des représentations simplifiées des systèmes biologiques dans lesquels les composants du système tels que les gènes, les protéines ou les cellules sont représentés par des noeuds et les interactions entre eux par les arêtes [25]. Les modèles de réseau booléen, initialement introduits par Kauffman [26, 27], représentent les modèles dynamiques discrets les plus simples. Ces modèles supposent seulement deux États discrets pour les noeuds d`un réseau, ON ou OFF, correspondant aux valeurs logiques 1 (actif) ou 0 (non actif, mais pas nécessairement absent) [28]. Un modèle logique bien conçu pourrait générer des résultats prédictifs en raison d`un ensemble de conditions initiales. Des cadres qualitatifs et logiques ont émergé comme des approches pertinentes avec différentes applications, comme en témoigne un nombre croissant de modèles publiés [29]. En complément de ces applications, plusieurs groupes ont fourni diverses méthodes et outils pour soutenir la définition et l`analyse des modèles logiques, comme cela peut être vu par les récentes réalisations du Consortium pour les modèles et outils logiques (CoLoMoTo) dans la logique modélisation [30]. Il existe déjà plusieurs outils pour la modélisation booléenne des réseaux de régulation dans lesquels il est possible de définir des relations directes d`inhibition d`activation entre les composants du réseau, tels que BoolNet R [31] ou GINsim [32]. Plus récemment, le paquet R SPIDDOR (pharmacologie des systèmes pour le développement efficace de médicaments sur R), entre autres, a mis en place de nouveaux types d`interactions et de perturbations réglementaires dans le système, tels que les modulateurs positifs et négatifs et la les altérations du polymorphisme, qui conduisent à une dynamique plus riche entre les noeuds [28]. Référence: Sollid LM, Johansen F-E (2008) modèles animaux de la maladie intestinale inflammatoire à l`aube de la nouvelle ère génétique. PLoS med 5 (9): E198.

https://doi.org/10.1371/journal.pmed.0050198 le Wellcome Trust Case Control Consortium, 2007 [6] un document novateur qui rapporte des études de GWA sur sept maladies, dont le CD. Plusieurs nouveaux gènes impliqués dans l`IBD ont été rapportés. Les premiers cas publiés de l`IBD familiale à partir du colloque de Londres 1909: (a) frère et sœur, (b) père et sœur, et (c) père et soeur d`un troisième patient, ont été considérés comme des «coïncidences», et ce point de vue a prévalu pendant plus de 50 ans. Les rapports sur la maladie intestinale inflammatoire «familiale» apparaissent dans les années 1960 et augmentent par la suite, ce qui indique une hanche des relations génétiques dans l`IBD [126-129]. Dans l`étude actuelle, nous présentons un modèle de réseau de pharmacologie (SP) pour IBD basé sur les cellules principales et les protéines impliquées dans la maladie. Notre analyse semble opportune, car l`IBD a récemment attiré une attention croissante [55 – 59]. Nous avons tenté de répondre à l`un des principaux défis de la maladie intestinale inflammatoire (EIA), qui est l`intégration des informations relatives à l`EIA pour construire un modèle prédictif.

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