exemple de calcul du lod score

Cela a conduit à la conclusion que certains traits sont liés les uns aux autres en raison de leur proximité les uns aux autres sur un chromosome. Le fait de considérer une hypothèse alternative en utilisant le score maximum de Lod, Zmax (qui équivaut à des essais H0: q = 1/2 versus H1: q 1/2) réduit en fait considérablement la fiabilité du test. L`objectif est de vérifier si le lien génétique entre une maladie et son (ses) marqueur (s) est le même dans tous les sous-groupes. Il est connu comme la distance génétique, et est mesurée en Morgans. Dans d`autres lignées, l`allèle à l`origine de l`ongle-patella est relié à l`allèle de type sanguin O. Pour ce faire, nous pouvons utiliser des familles avec une ou plusieurs personnes touchées et dans lequel le génotype de chaque membre de la famille est connu en ce qui concerne le marqueur T. Il s`agit d`un point important de la génétique—pas tous les liens entre les allèles de deux gènes se trouvent être constants dans toute une espèce. Étant donné qu`il existe deux types parentaux, cette valeur est divisée par deux pour donner une valeur de 0. Même si nous travaillons avec les deux mêmes gènes, l`ongle-patella et le type sanguin, dans ce pedigree l`allèle dominant semble être couplé avec l`allèle de type A de sang. Le «test de mélange» est ensuite étendu pour déterminer la proportion de familles dans lesquelles chacun des trois gènes est impliqué (Legeai-Mallet et al, 1997), et la possibilité qu`il y ait un quatrième gène. Les trois emplacements des chromosomes 8, 19 et 11 ont été signalés comme El, E2 et E3, et les proportions des familles concernées en tant qu`Al, a2 et a3 respectivement. En 1955, Morton a fourni un ensemble de tableaux donnant les scores LOD pour diverses valeurs de q pour un locus de la maladie et un locus marqueur pour les familles nucléaires avec des tailles de frères de 2 à 7.

Le tableau ci-dessous montre le changement dans ces conditions d`application. Le même processus est répété avec une autre estimation de la distance de liaison. La mesure utilisée sur la carte génétique n`est pas la fraction de recombinaison, qui n`est pas un zéro additif, mais la distance génétique, que nous définirons ci-dessous. Deux marqueurs génétiques qui sont physiquement proches les uns des autres sont peu susceptibles d`être séparés sur différentes chromatides pendant le croisement chromosomique, et sont donc dit être plus liés que les marqueurs qui sont éloignés.

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